В 2029 году кибернетические протезы стали обычным делом. Многие меняют руки и ноги на механические, чтобы стать сильнее или быстрее. Майор Мотоко Кусанаги работает в отделе безопасности под номером девять. Её команда ищет хакера. Он скрывается в сети и носит странное имя — Кукловод. Расследование сложное, нить постоянно теряется в цифровом лабиринте.